ДИСИ активно сарађује са институцијама у земљи и иностранству које предњаче у области дигиталне хуманистике, попут Универзитетске библиотеке ''Светозар Марковић'' са којој учествује у развијању демократизације процеса дигитализације применом СкенТент технологије, као и са Народном библиотеком Србије. Развија се и сарадња са Аудиовизуелним архивом и центром за дигитализацију САНУ, Архивом отвореног друштва из Будимпеште и Институтом за рат, холокауст и геноцид из Амстердама.