Институт за савремену историју посебну пажњу посвећује сарадњи са тематски сродним институцијама у земљи и иностранству.
Сарадња са научним, архивским, образовним и културним институцијама у земљи
– Балканолошки институт САНУ
– Историјски институт
– Институт за новију историју Србије
– Институт за стратегијска истраживања
– Архив Југославије
–Државни архив Србије
– Историјски архив Београда
–Завод за заштиту споменика културе града Београда
– Архив Војводине, Нови Сад
– Историјски архив „Тимочка крајина“ Зајечар
– Историјски архив „Срем“ Сремска Митровица
– Историјски архив Ужице
– Филозофски факултет Универзитета у Београду
– Филозофски факултет Универзитета у Нишу
– Филозофски факултет у Косовској Митровици
– Народни музеј
– Музеј Југославије
– Историјски музеј Србије
– Музеј града Београда
– Народни музеј Лесковац
– Народни музеј Шабац
– Народни музеј Александровац
–Центар за културу „Масука“, Велика Плана
Међународна научна сарадња са научним и образовним институцијама
– Одељење за историју Југоисточне Европе, Универзитет у Грацу
– Одељење за историју, Универзитет у Пердјуу, Индијана, САД
– Одељење за историју, Универзитет у Новом Мексику
– Одељење за историју, Централноевропски универзитет, Будимпешта
– Одељење за историју, Меиђи универзитет, Токијо
– Одељење за историју Универзитета Керни, Небраска
– Школа словенских и источноевропских студија, Лондон
– Уралски државни универзитет, Екатеринбург
– Леибниз-Институт für Ост- унд Südosteuropaforschung
– Хрватски институт за повијест, Загреб
– Институт за савремену историју, Праг
– Историјски институт Црне Горе, Подгорица
– Институт за новејшо згодовино, Љубљана
– Институт за хисторију, Сарајево
– Републички центар за истраживање рата, ратних злочина и tražewe несталих лица, Бања Лука
– Архив Републике Српске
– Филозофски факултет Пале
– Архив срба у Хрватској.