DISI aktivno sarađuje sa institucijama u zemlji i inostranstvu koje prednjače u oblasti digitalne humanistike, poput Univerzitetske biblioteke “Svetozar Marković” sa kojom učestvuje u razvijanju demokratizacije procesa digitalizacije primenom ScanTent tehnologije, kao i sa Narodnom bibliotekom Srbije. Razvija se i saradnja sa Audiovizuelnim arhivom i centrom za digitalizaciju SANU, Arhivom otvorenog društva iz Budimpešte i Institutom za rat, holokaust i genocid iz Amsterdama.