ДИСИ активно сарађује са институцијама у земљи и иностранству које предњаче у области дигиталне хуманистике, попут Универзитетске библиотеке “Светозар Марковић” са којом учествује у развијању демократизације процеса дигитализације применом СцанТент технологије, као и са Народном библиотеком Србије. Развија се и сарадња са Аудиовизуелним архивом и центром за дигитализацију САНУ, Архивом отвореног друштва из Будимпеште и Институтом за рат, холокауст и геноцид из Амстердама.